Stéphane Stoll a rejoint le groupe Bouygues en 1994 et a débuté son parcours chez Bouygues SA comme chargé de mission auprès du directeur général Construction, puis au sein des équipes d’audit interne Groupe pendant 5 ans.
Il rejoint Bouygues Energies & Services (alors ETDE) en 2002 pour participer au développement des activités de Facility Management dans des fonctions d’abord financières puis opérationnelles.
Il devient Secrétaire Général de Bouygues Energies & Services en 2010, puis directeur général adjoint en charge du Développement, de l’Innovation et de la Transformation Digitale en 2017.
À l’acquisition à l’été 2018 des activités Energies & Services d’Alpiq, il prend la direction générale de Kraftanlagen en Allemagne. Il en assure l’intégration et la réorganisation pendant 3 ans.
En 2021 il prend la direction des activités Energies & Industrie de Bouygues Energies & Services.
En janvier 2023, il rejoint Equans, dont il dirige les activités Central Europe – Data Centers – Energies Solar & Storage jusqu’en juillet 2025.
Stéphane Stoll est nommé directeur général adjoint et directeur financier du groupe Bouygues à compter du 1er août 2025 et intègre le comité de direction générale.